بیش از دو دهه است که رشد در اندازه و پیچیدگی داده‌های زیستی، جامعه‌ی علمی را به سمت و سوی تلاش برای کسب دیدگاهی سیستمی و یکپارچه از موجود زنده سوق داده و موجب گسترش ابزارهایی متناسب با این هدف در حوزه‌ی زیست‌شناسی سیستم‌ها شده است. اهمیت جهانی متابولیسم و علاقه به مهندسی آن در تمامی قلمروی حیات، به منظور حصول طیف وسیعی از اهداف، آن را موضوعی محوری در زیست‌شناسی سیستم‌ها قرار داده است. مدل‌های متابولیک در مقیاس ژنوم (GEMs) یکی از برجسته‌ترین ابزارهای پژوهش در زمینه‌ی متابولیسم است که آشنایی با اصول، روش‌‌های ساخت و آنالیز، ابزارهای در دسترس، کاربردها، تلفیق داده‌های امیکس و ساخت شبکه‌‌های مختص‌ زمینه، تلفیق با دیگر مدل‌ها و ایجاد مدل‌‌های چندلایه، و بهره‌گیری از یادگیری ماشین، در زمینه‌ی مدل‌سازی متابولیک، به منظور ایجاد یک تصویر کلی از تحقیقات جاری ، اهداف اصلی این دوره‌ی کوتاه‌مدت است.

محورهای جلسه:

• شناختی کلی از ریاضی استفاده شده در مدل های متابولیک
• استفاده از ابزارهای مبتنی بر پایتون برای دستورزی مدل ها و آنالیز آن ها