این کورس آموزشی بر روی انجام تجزیه و تحلیل یکپارچه داده های بیانی transcriptomics و بالینی با استفاده از برنامه نویسی R ، با توجه به داده های TCGA و GEO، تمرکز دارد. این کارگاه با هدف آموزش شرکت‌کنندگان به دانش ومهارت‌های لازم برای استفاده از این ابزار قدرتمند در تلاش‌های تحقیقاتی خود انجام می‌شود. با یادگیری مهارت ها دراین کارگاه، توانایی لازم برای کشف پیچیدگی های سیستم های بیولوژیکی فراهم می‎شود. همچنین، بینش عمیقی در مورد فرآیندهای سلولی ، مدل های پیش بینی، و دانش بیومولکولی سرطان فراهم می‎‌شود.

محورهای جلسه:

1.آشنایی با محیط نرم افزار R و کدنویسی های کاربردی
2.آنالیز و پردازش داده های بیانی سرطان از اطلس ژنوم سرطان (TCGA)
3.نحوه دانلود و پردازش داده های میکرواری از GEO 
4.تصویرسازی و ترسیم نمودارهای آنالیزی به همراه آنالیز اینریجمنت ژن ها برای درک مسیرهای سلولی و مولکولی GO و KEGG 
5.آنالیز داده های میکرو آر ان ای و تعیین اینترکشن های مولکولی در شبکه ceRNA 
6.آشنایی با دیتابیس های اختصاصی جهش مانند COSMIC، cBioPortal