خلاصه ارائه
آشنایی اولیه با نرم افزار VMD و NAMD .
آشنایی با سایت
rcsb.org و دیتا بیس PDB .
آشنایی با انواع فایلهای ساختاری pdb و topology و …
نمایش انواع مولکولها در VMD .
ساخت فایل PSF برای پروتیین و لیگاند توسط نرم افزار VMD و سایت
CHARMM-GUI.ORG.
آشنایی با دینامیک مولکولی و نحوه ی محاسبه ی واکنشهای بین مولکولی توسط نرم افزار NAMD .
آنالیز خروجی های NAMD و نیروهای بین مولکولی.
در این کارگاه سعی شده موارد فوق برای پروتیین های غشایی ویروس COVID-19 و لیگاندهای مختلف، بررسی شود.
مدرس
نوید وزیری‌نسب، دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه صنعتی امیرکبیر
زمان برگزاری
۲۴ بهمن ۱۴۰۲، ساعت ۱۷ الی ۲۰
با ارائه مدرک معتبر پس از پایان سمپوزیوم
